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具红字增值税专用发票的流程分为三步：填开《开具红字增值税专用发票信息表》（以下简称《信息表》）、接收校验通过《信息表》和销售方开具红字发票。
需要注意的是，并非开具所有红字发票都需要先填开《信息表》，目前开具增值税普通发票、增值税电子普通发票和机动车销售统一发票的红字发票不需要填写《信息表》，可以在开票系统中直接开具红字发票。
《信息表》由哪一方提交
根据《国家税务总局关于红字增值税发票开具有关问题的公告》（国家税务总局公告2016年第47号）的规定，申请填开《信息表》的具体情况分析如下：
（1）购买方取得专用发票并用于申报抵扣的，发票联和抵扣联在购买方，由购买方填开《信息表》。
（2）购买方取得专用发票未用于申报抵扣，但无法退回的，发票联和抵扣联在购买方，由购买方填开《信息表》。
（3）销售方申请的情况，发票没交给购买方，或已经退回，发票联和抵扣联在销售方，由销售方填开《信息表》。
所以，可以简便记忆：发票联和抵扣联在哪方就由哪方申请。
超过认证期发票被退回能开红字发票？
对符合以上红字发票开具范围规定的可以开具，仅因超期未认证原因是不允许用专用发票冲红的。
自从推行了增值税发票管理新系统，已实现全面采集发票内容，通过大数据分析，很容易筛选出蓝字发票超过认证期限先冲红，又重新开具内容与原来一模一样的发票。如果仅因逾期未认证，销售方违规开具了红字发票，将会面临税务行政处罚；而购买方则会面临补税罚款的处罚。
购买方申请了红字通知单，什么时候申报进项税转出？
购买方需要在填开信息表的次月申报期就按信息表所列税额进行转出申报，而非等到红字发票收到再转出。
购买方取得专用发票已用于申报抵扣的，购买方可在增值税发票管理新系统中填开并上传《信息表》，在填开《信息表》时不填写相对应的蓝字专用发票信息，应暂依《信息表》所列增值税税额从当期进项税额中转出，待取得销售方开具的红字专用发票后，与《信息表》一并作为记账凭证。
申报系统会自动比对抄报税抄送的红字信息表的增值税额，如果和当期填报的《增值税纳税申报表》附表2第20栏不一致，就会无法申报。